胰蛋白胨是許多異養微生物的優良氮源，用于細菌的培養、分離、增殖、鑒定

胰蛋白胨還能夠檢測罐頭食品中的“平酸”或硫化物酸敗細菌，

所以也可用于無菌測試培養基，以及厭氧菌培養基等細菌生化特性試驗用培養基的配置。

胰蛋白胨還廣泛應用于高品質的抗生素、胞外蛋白、干擾素、白喉類毒素、

維生素等醫藥工業，氨基酸、有機酸、酶制劑、黃原膠等發酵工業，

生化制品及微生物學科研等領域中。